Amenorrea con pastillas anticonceptivas

Hola,
Hace aproximadamente 1 año y 4 meses tomo las pastillas Isis mini 24, jamas me he saltado una, solo maximo que me ha pasado es tomarla 2 horas después.
Usualmente me viene el periodo el primer dia de cada caja o el ul!@#*! de las blancas, pero esta vez solo tuve mucosidad marron y muy poquita sangre, no como para considerarse el periodo.
Se que esto puede pasar a veces pero de todas maneras me hice una prueba y de embarazo y salio negativa, ya han pasado varios dias y me duelen los ovarios.
Esto puede deberse a la ausencia de regla?
Gracias!